La localisation du Collège d'Europe à Natolin en Pologne, un pays à proximité de la frontière orientale de l’Union européenne, en fait un point de départ idéal pour l'exploration de l'impact politique et socio-économique de l'UE en Europe centrale et orientale et dans les voisinages de l'UE.
Tous les étudiants doivent rédiger et défendre un mémoire sur un sujet traité dans le cadre du programme d'études. Le mémoire est le fruit d’une recherche individuelle et permet aux étudiants d’approfondir leur connaissance et leur compréhension d’un sujet en particulier.
La filière repose sur deux axes : les acteurs et les problématiques. D'une part, les étudiants acquièrent des connaissances sur les défis pressants liés au commerce, aux investissements, à l'énergie, la gouvernance économique, la réglementation financière, la sécurité, au terrorisme, aux droits de l'homme, aux migrations, à la santé, la coopération au développement et à l'aide humanitaire.
Le programme académique en Études européennes interdisciplinaires est adapté aux évolutions économiques, politiques et sociales, ainsi qu'aux progrès technologiques, et ce chaque année.
Au deuxième semestre, les étudiants de Natolin peuvent choisir l'une des quatre filières thématiques, personnalisables en fonction des intérêts des étudiants :
Le premier semestre du programme en Études européennes interdisciplinaires à Natolin s’articule autour des grandes composantes des études européennes, d’une part, et des éléments principaux de l’histoire et de la politique européennes, d’autre part.